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沈阳市疾病预防控制中心
沈阳市疾病预防控制中心是在原沈阳市卫生防疫站基础上组建的。沈阳市卫生防疫站成立于1952年，是全国最早建立的市级卫生防疫站机构之一，1998年成为全国省会市级一等站。2002年1月经机构重组，沈阳市疾病预防控制中心成立。
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武汉市疾病预防控制中心
武汉市疾病预防控制中心是负责武汉地区疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情报告及健康相关因素信息管理、健康危害因素监测与干预、实验室检测分析与评价、健康教育与健康促进、技术管理与应用研究指导的公益性事业单位。
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东莞市疾病预防控制中心
东莞市疾病预防控制中心是在原东莞市卫生防疫站的基础上于2002年12月重新组建的副处级事业单位，并增挂东莞市卫生检验中心和东莞市健康教育所牌子。
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中国疾病预防控制中心麻风病控制中心
中国疾病预防控制中心麻风病控制中心（以下简称“麻风中心”）座落在江苏省南京市紫金山北麓，前身为1954年在北京成立的“中央皮肤性病研究所”（即现在的“中国医学科学院中国协和医科大学皮肤病医院（研究所）”，以下简称“医科院皮研所”），直属卫生部领导，重点承担指导全国性病防治任务。
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大连市疾病预防控制中心
大连市疾病预防控制中心是在卫生体制改革中于2002年2月6日在原大连市卫生防疫站、市劳动卫生研究所、市健康教育中心的基础上组建的新型综合性疾病预防控制机构，担负着疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情报告及相关因素信息管理、健康危害因素监测与干预、实验室检测分析与评价、健康教育与健康促进、技术管理与应用研究指导的七大职能。
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北京市疾病预防控制中心
北京市疾病预防控制中心、北京市预防医学研究中心是根据国务院关于卫生监督、卫生防病体制改革的总体要求，在北京市卫生防疫站，北京市劳动卫生与职业病防治研究所、北京市健康教育所、北京市性病防治所的基础上，于2000年6月正式组成的市级卫生事业单位。
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中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
传染病预防控制所（以下简称传染病所）是中国疾病预防控制中心领导下的国家级传染病预防控制专业机构，是全国传染病预防控制业务技术指导中心。
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